T2D@ZJU:2型糖尿病网络药理学研究软件平台

 2型糖尿病(T2D)是现代人类健康的重大威胁之一。随着对其发病机制研究的深入,能量代谢紊乱、炎症反应、线粒体功能受损、氧化应激、内质网应激等一系列与2型糖尿病的发生发展相关的关键分子事件先后被提出。但对2型糖尿病的研究还远未结束,对其发病机理的探究还在不断深入。因此,亟需对已有的2型糖尿病相关知识进行整理和总结,以便在分子水平全面认识和理解2型糖尿病的发病机制。

下面对本研究构建的2型糖尿病网络药理学软件平台T2D@ZJU及其应用作一建立介绍。

1. T2D@ZJU系统构建研究

T2D@ZJU的结构见图6,包括三个层次的数据,分别为经审核的有向连接(curated directed connectionsCDC)数据集,PPI数据集,基于文本挖掘关系(text-mining-based relationshipsTMR)数据集。由于三个层次的数据有不同的信息覆盖面和可信程度,故三者为互补关系。


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2. T2D@ZJU的应用

 T2D@ZJU对用此进行学术研究的用户免费开放,网址为http://pharminfo.zju.edu.cn/t2d,通过一个用户友好的网络界面可供用户浏览、搜索和下载数据。其主要功能总结如下图。

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3. 小结

 T2D@ZJU通过网络的形式,将多来源的、多层次的信息通过整合后予以呈现。T2D@ZJU是一个包括三个不同层次信息来源的整合知识库,是对现有2型糖尿病相关知识的汇总和整理,并在此基础上构建2型糖尿病疾病网络。基于信息的可靠程度和信息的覆盖面,其提供了一个全面的观察、研究该疾病的新视角,可进一步用于网络药理学和多靶点药物设计与治疗方面的研究。


文章链接:http://database.oxfordjournals.org/content/2013/bat052